* Noticia importante: bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud ni tratarse como información establecida.
En un estudio reciente publicado en el bioRxiv* servidor de preimpresión, los investigadores investigaron si las plagas de roedores comensales, como ratas y ratones, provenientes de alcantarillas y entornos urbanos, están expuestas y están infectadas con el síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2). También investigaron virus presentes en roedores comensales.
Los animales adquieren enfermedades virales de forma natural, y algunos organismos virales causantes pueden poseer potencial de transmisión zoonótica. La pandemia de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) llamó la atención de los investigadores sobre la posibilidad de una transmisión inversa del SARS-CoV-2 de humanos a roedores. Se sabe que las especies de roedores transmiten virus a los humanos y han sido acusadas de probables reservorios de SARS-CoV-2 (y otros CoV).
Estudio: La ecología de los virus en roedores urbanos con enfoque en el SARS-CoV-2. Haber de imagen: Rudmer Zwerver/Shutterstock
Sobre el estudio
En el presente estudio, los investigadores investigaron y describieron la gama de virus que se encuentran en ratas y ratones e investigaron la exposición e infección de especies de roedores comensales con el SARS-CoV-2.
El equipo tomó muestras de ratones (Apodemus silvaticus) y ratas (Rattus norvegicus) de entornos urbanos en 2020 durante la pandemia humana por SARS-CoV-2. La captura principal ocurrió entre el 15 de junio de 2020 y el 20 de noviembre de 2020 en la ciudad de Liverpool en Inglaterra y sus alrededores. El equipo atrapó en vivo el 45 y el 35 R. norvegicus ratas de Greenbank Park y una instalación de tratamiento de aguas residuales cerca del centro de la ciudad de Liverpool, respectivamente. sesenta y nueve a. sylvaticus Los ratones quedaron atrapados en varios parques urbanos de Liverpool, como Princes Park, Sefton Park, Wavertree Botanic Gardens y Calderstones Park. Se obtuvieron muestras de tejidos pulmonares e intestinales y heces de los animales roedores.
El ácido ribonucleico (ARN) extraído de los tejidos se sometió a análisis de secuencia metagenómica para virus y análisis de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para la detección de SARS-CoV-2. Se evaluó el número de virus, la prevalencia de diferentes virus, el número de infecciones causadas por diferentes virus, la carga viral de diferentes virus y la especificidad del tejido. Los extractos fluidos de tejidos cardíacos, hepáticos y pulmonares se sometieron a ensayos de inmunoabsorción ligados a enzimas (ELISA) para medir los títulos de inmunoglobulina G (IgG) e IgA de la proteína pico (S) anti-SARS-CoV-2.
in vitro Se realizaron ensayos de neutralización que utilizan PVP (partículas de virus pseudotipadas) envueltas en SARS-CoV-2 que codifican la cepa S de Wuhan-Hu-1 para evaluar la inhibición de la infección por SARS-CoV-2 por fluido de tejido cardíaco y pulmonar de rata salvaje en el embrión humano riñón (HEK) 293T enzima convertidora de angiotensina 2 (ACE2) -células transmembrana serina proteasa 2 (TMPRSS2). A modo de comparación, ratas de laboratorio SPF y Mus musculus ratones, con alto (108 partículas de virus/tejido gramo) y bajo (104 partículas de virus/tejido de gramo) dosis de SARS-CoV-2 inactivado, se incluyeron como controles negativos.
Como controles positivos se utilizaron ratas Wister y C57BL/6J inmunizadas por vía intramuscular con SARS-CoV-2 S. Además de los roedores atrapados, los controladores de plagas proporcionaron 41 ratas del sur de Inglaterra y se tomaron muestras de un área residencial en Reading y una instalación de eliminación de desechos domésticos en Basingstoke. Los roedores proporcionados por los controladores de plagas se utilizaron únicamente para el análisis serológico.
Resultados
En total, 6,0 x 109 y 1,0 x 1010 se obtuvieron lecturas para muestras de ratones y ratas, respectivamente, de las cuales se identificó que el 4,0 % y el 2,0 % de las lecturas de los animales correspondientes eran de origen viral, respectivamente. Entre las muestras, se detectaron 297 virus en las muestras, de los cuales, 264 virus, 13 virus y 20 virus solo se detectaron en ratas, ratones y especies de roedores, respectivamente. Entre las ratas, se detectaron 97 organismos virales exclusivamente en tejidos pulmonares, siete virus exclusivamente en tejidos intestinales y cuatro virus exclusivamente en heces de rata, con <50% de virus mostrando especificidad tisular. La mayoría de los virus detectados en los roedores pertenecían a cuatro familias de virus, es decir, Baculoviridae, Picornaviridae, astroviridaeo Poxviridae. Ningún virus de la Coronaviridae la familia se detectó en ratones; sin embargo, la familia condujo al 1,0% de las enfermedades virales entre las ratas.
En ratones, Simbu orthobunyavirus, Ortobunyavirus Shamonda(Ambos de Peribunyaviridae familia y Choristoneura fumiferana granulovirus (de Baculoviridae familia) tuvo una prevalencia >50%. Entre las ratas se encontraron 23 organismos virales con > 50% de prevalencia, provenientes del Picornaviridae, virgaviridae, y Nodaviridae familias En ratas, los virus con > 0,50 % de lecturas de secuencia fueron el virus Boolarra, el rosavirus B, el cardiovirus C y el hunnivirus. En ratones, los virus que representan > 1,0 % de las lecturas fueron Choristoneura fumiferana granulovirus, Shamonda orthobunyavirus, y Simbu orthobunyavirus.
Tres ratas mostraron lecturas de SARS-CoV-2 superiores a 104 Partículas de SARS-CoV-2/gramo de tejido. Además, se obtuvieron tres muestras positivas de un grupo de tejidos pulmonares de tres ratas y dos grupos de tejidos intestinales, cada uno procedente de tres ratas atrapadas vivas diferentes. Ocho, 72 y 39 pares de lecturas en las muestras positivas se alinearon con el genoma del SARS-CoV-2, lo que representa una contaminación de bajo grado. Ninguna de las muestras de ratones tuvo más lecturas de SARS-CoV-2 que los controles positivos.
Se identificaron lecturas metagenómicas de CoV en ratas, particularmente Ferret CoV (alfa-CoV) en siete muestras, Rhinolophus bat CoV HKU2 (alfa-CoV) en una muestra y MERS (síndrome respiratorio de Oriente Medio) -CoV (beta-CoV) en siete muestras de ratas. Sin embargo, no se detectaron CoV por encima del límite entre los ratones, y el análisis de PCR no mostró presencia de SARS-CoV-2 en los roedores. La mayoría de los roedores tenían títulos anti-S IgA e IgG muy bajos, aunque siete ratas tenían densidades ópticas (OD) comparables al control positivo para las respuestas humorales pulmonares. Tres (de 15) muestras cardíacas de rata mostraron una inhibición de la infección por SARS-CoV-2 de un 36 % a un 70 % y cuatro muestras de pulmón de rata inhibieron la infección por SARS-CoV-2 de un 39 % a un 61 %.
En general, los hallazgos del estudio no mostraron pruebas moleculares de infección por SARS-CoV-2 en los roedores, aunque, en ratas, se observaron títulos pulmonares de IgA anti-SARS-CoV-2 S y neutralización parcial de SARS-CoV-2. Los hallazgos indicaron que la exposición de las ratas al SARS-CoV-2 u otros virus resultó en títulos de anticuerpos de reacción cruzada.
* Noticia importante
bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud ni tratarse como información establecida.
* Noticia importante: bioRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica o el comportamiento relacionado con la salud ni tratarse como información establecida.
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